IZA je analytickým a poradným útvarom Ministerstva zdravotníctva SR spadajúci pod Ministra zdravotníctva. Podieľa sa na dodávaní podkladov pre dátovo podložené rozhodnutia v zdravotníctve a dohliada na zvyšovanie efektivity a kvality v zdravotníctve. Príklady oblastí a tém, ktorými sa IZA zaoberá sú: mapovanie využívania zdravotnej starostlivosti na Slovensku, benchmarking cien liekov či zdravotníckej techniky, optimalizácia siete nemocníc, urgentných príjmov, prvej pomoci a rôznych zaujímavých nárazových analýzach v zdravotníctve (akou je teraz pochopiteľne téma Covid).
IZA úzko spolupracuje s útvarmi na ministerstve (ako Sekcia reformnej agendy), ako aj s inými analytickými inštitútmi v štátnej správe ako UHP, IFP a podobne.